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Timm病理染色是一种能够显示组织细胞内重金属分布的常用方法。苔藓纤维末端是脑内含锌量高的区域，因此可以用此方法显示苔藓纤维末梢分布的情况
茜素红病理染色;茜素红与钙发生显色反应，产生一种深红色的带色化合物，这样成骨诱导的细胞外面沉积的钙结节也就被染成了深红色。
TTC病理染色原理：TTC（2，3，5—氯化三苯基四氮唑）是脂溶性光敏感复合物，它是呼吸链中吡啶—核苷结构酶系统的质子受体，与正常组织中的脱氢酶反应而呈红色，而缺血组织内脱氢酶活性下降，不能反应，故不会产生变化呈苍白。
组织普鲁士蓝染色是非常经典的组织化学反应，是显示组织内三价铁的一种敏感、传统优良的方法，其染色原理为：三价铁离子从蛋白质中被稀盐酸分离出来，生成不溶解的蓝色化合物，即普鲁士蓝。
ACP染色：酸性磷酸酶染色，血细胞内的酸性磷酸酶在酸性条件下，将基质中的磷酸萘酚AS-BI水解，释放萘酚AS-BI，萘酚AS-BI与六偶氮付品红偶联，形成不溶性红色沉淀，定位于胞质内，如果血细胞的胞质呈红色为阳性反应，无红色为阴性反应。
NAP染色实验：碱性磷酸酶染色（NAP）在临床的应用基本属于常规筛查的染色法；专门用于血液或骨髓细胞涂片的中性粒细胞的碱性磷酸酶染色，又称同时偶联法。碱性磷酸酶活性部位呈蓝色，位于胞浆中。油镜下计数101个中性粒细胞，求出百分比和积分。非特异性反应少，结果可靠。
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